大多人都知道認定高新技術企業(yè)真的是好處多多。相比普通企業(yè)來說，高新技術企業(yè)所得稅15%低稅率優(yōu)惠，并且減免40%，而普通企業(yè)所得稅稅率為25%，這一項稅收優(yōu)惠就已經令很多企業(yè)望塵莫及了。再例如，高新技術企業(yè) 職工教育經費支出，不超過工資薪金總額8%的部分，準予稅前扣除，而普通企業(yè)的扣除比例為2.5%；并且中小高新企業(yè)轉增資本個人所得稅可以在5年之內分期納稅，普通企業(yè)則必須當年繳納。另外對企業(yè)研發(fā)費用，按50%加計扣除或按照無形資產成本的150%攤銷、符合條件的技術轉讓所得可以減免企業(yè)所得稅，這兩項對所有企業(yè)都適用的稅收優(yōu)惠，更是讓高新技術企業(yè)占盡先機。
高新技術企業(yè)認定稅務風險
但是對取得高新技術企業(yè)資格且享受稅收優(yōu)惠的高新技術企業(yè)，稅務部門如在日常管理過程中發(fā)現(xiàn)其在高新技術企業(yè)認定過程中或享受優(yōu)惠期間不符合《認定辦法》第十一條規(guī)定的認定條件的，應提請認定機構復核。復核后確認不符合認定條件的，由認定機構取消其高新技術企業(yè)資格，并通知稅務機關追繳其證書有效期內自不符合認定條件年度起已享受的稅收優(yōu)惠。

應對高新技術企業(yè)財務核算進行稅務合規(guī)性管理，需要重點關注幾大問題：
其一、高新技術政策與研發(fā)費加計扣除政策的區(qū)別，不要將兩者混淆，造成稅務風險；
其二、研發(fā)領料退回或者下腳料收入應沖減研發(fā)費用；
其三、按照企業(yè)所得稅匯算清繳申報表的條目單獨歸集研發(fā)費加計扣除的研發(fā)費；
其四、研發(fā)費加計扣除不再需要到科技部門立項，企業(yè)自主立項即可。